Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX2Q13950 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUNX2Q13950 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX2Q13950 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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