Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRJQ12913 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRJQ12913 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms