Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PRM10YJL108C 1152 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PRP45YAL032C 1140 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 LIP2YLR239C 987 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YIP3YNL044W 531 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 RSC6YCR052W 1452 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 LDB17YDL146W 1476 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 GDB1YPR184W 4611 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ULA1YPL003W 1389 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 OMS1YDR316W 1416 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 GIR2YDR152W 798 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YDR222WYDR222W 1248 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ERD1YDR414C 1089 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PSR1YLL010C 1284 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 TFS1YLR178C 660 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 MRPL4YLR439W 960 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YNR042WYNR042W 429 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ATG19YOL082W 1248 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 snR17bsnR17b 332 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 TDA7YNL176C 1911 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 MAD3YJL013C 1548 nt4.91□□□□□ -1.62
HER1Q12276 NOC4YPR144C 1659 nt4.9□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YHR182WYHR182W 2358 nt4.9□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YDL034WYDL034W 345 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 BUD16YEL029C 939 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 HAT2YEL056W 1206 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YFR035CYFR035C 345 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 MRPL13YKR006C 795 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 CTL1YMR180C 963 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 DAL82YNL314W 768 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YOR289WYOR289W 756 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 BTS1YPL069C 1008 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YBR089WYBR089W 600 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 CDC28YBR160W 897 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ALD3YMR169C 1521 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ALD2YMR170C 1521 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 CMK1YFR014C 1341 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 FZO1YBR179C 2568 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 STE20YHL007C 2820 nt4.9□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YHR045WYHR045W 1683 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 TPS3YMR261C 3165 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 GRX6YDL010W 696 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ERV14YGL054C 417 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YHR054CYHR054C 1065 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 AIR1YIL079C 1083 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 SAW1YAL027W 786 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 COS9YKL219W 1224 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YLL059CYLL059C 507 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 BLS1YLR408C 369 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YBL029WYBL029W 1131 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 MRP21YBL090W 534 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ROX3YBL093C 663 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 SFT2YBL102W 648 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 QCR2YPR191W 1107 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ATG20YDL113C 1923 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 RKM2YDR198C 1440 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ELP2YGR200C 2367 nt4.89□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YER134CYER134C 537 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ERG26YGL001C 1050 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YAR061WYAR061W 204 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 CDA2YLR308W 939 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YOR342CYOR342C 960 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 HXT7YDR342C 1713 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 HXT6YDR343C 1713 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 TIP20YGL145W 2106 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 RTT106YNL206C 1368 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 PRO2YOR323C 1371 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YJL206CYJL206C 2277 nt4.88□□□□□ -1.63
HER1Q12276 BRE2YLR015W 1518 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 MSH1YHR120W 2880 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 CLF1YLR117C 2064 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YPT32YGL210W 669 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 WSS1YHR134W 810 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 MRPL6YHR147C 645 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 PGU1YJR153W 1086 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YMR010WYMR010W 1218 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YMR082CYMR082C 357 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YNL303WYNL303W 348 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 PRM4YPL156C 855 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 snR189snR189 189 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YPR109WYPR109W 885 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ESF1YDR365C 1887 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ARG4YHR018C 1392 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 NOT3YIL038C 2511 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ALG2YGL065C 1512 nt4.87□□□□□ -1.63
HER1Q12276 AXL2YIL140W 2472 nt4.86□□□□□ -1.63
HER1Q12276 ADE6YGR061C 4077 nt4.86□□□□□ -1.63
HER1Q12276 MRPL32YCR003W 552 nt4.86□□□□□ -1.63
HER1Q12276 YDR336WYDR336W 945 nt4.86□□□□□ -1.63
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