Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YIL055CYIL055C 1884 nt6.28□□□□□ -1.4
SSF2Q12153 AI3Q0060 1248 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 UBC1YDR177W 648 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RPB7YDR404C 516 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 COS4YFL062W 1140 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SNL1YIL016W 480 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RPF2YKR081C 1035 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 COS3YML132W 1140 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 PDR16YNL231C 1056 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 NAT3YPR131C 588 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 KTR3YBR205W 1215 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 COS2YBR302C 1140 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SSK22YCR073C 3996 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 STE13YOR219C 2796 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 GAS3YMR215W 1575 nt6.27□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ALG9YNL219C 1668 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 BDP1YNL039W 1785 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ACF2YLR144C 2340 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 HXT4YHR092C 1731 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 KNH1YDL049C 807 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 COS7YDL248W 1152 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ENT5YDR153C 1236 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YDR509WYDR509W 348 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 MLC1YGL106W 450 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 BGL2YGR282C 942 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SEC28YIL076W 891 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 COS5YJR161C 1152 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ELA1YNL230C 1140 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RMI1YPL024W 726 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 GRX1YCL035C 333 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SOG2YOR353C 2376 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 PMT5YDL093W 2232 nt6.26□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 TEA1YOR337W 2280 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 TAX4YJL083W 1815 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 PRO3YER023W 861 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YGR219WYGR219W 342 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 DAL3YIR032C 588 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ECM1YAL059W 639 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 NIT3YLR351C 876 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 BSD2YBR290W 966 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 DED81YHR019C 1665 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RNR3YIL066C 2610 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ASA1YPR085C 1332 nt6.25□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YTA12YMR089C 2478 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 PRP9YDL030W 1593 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YDL158CYDL158C 309 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SLO1YER180C-A 258 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ARG3YJL088W 1017 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 VPS71YML041C 843 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YNL226WYNL226W 411 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 BTS1YPL069C 1008 nt6.24□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 VBA1YMR088C 1689 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SAC6YDR129C 1929 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YER085CYER085C 522 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RPT6YGL048C 1218 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 GMH1YKR030W 822 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SEC13YLR208W 894 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RUF21RUF21 707 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 TEX1YNL253W 1269 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YNG1YOR064C 660 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ATG14YBR128C 1035 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 MRPL37YBR268W 318 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ESC8YOL017W 2145 nt6.23□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 TOS4YLR183C 1470 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 SEO1YAL067C 1782 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 HAS1YMR290C 1518 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 FPK1YNR047W 2682 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YGR015CYGR015C 987 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 YIL060WYIL060W 435 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 NSE1YLR007W 1011 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 RHO2YNL090W 579 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 CKA2YOR061W 1020 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 snR19snR19 568 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 MEC3YLR288C 1425 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 ACS1YAL054C 2142 nt6.22□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 CSC1YLR241W 2349 nt6.21□□□□□ -1.41
SSF2Q12153 IME4YGL192W 1803 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YGR182CYGR182C 354 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YGR283CYGR283C 1026 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YOL162WYOL162W 648 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 MTC5YDR128W 3447 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 PHO8YDR481C 1701 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 VHT1YGR065C 1782 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 HXT5YHR096C 1779 nt6.21□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 HAT2YEL056W 1206 nt6.2□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 DDI2YFL061W 678 nt6.2□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 DDI3YNL335W 678 nt6.2□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 SUT2YPR009W 807 nt6.2□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YFL064CYFL064C 525 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 VMA16YHR026W 642 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 ATG16YMR159C 453 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YOR318CYOR318C 306 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 SUE1YPR151C 621 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 YPR202WYPR202W 717 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 TEC1YBR083W 1461 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 SFB3YHR098C 2790 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 HMS1YOR032C 1305 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 PTK2YJR059W 2457 nt6.19□□□□□ -1.42
SSF2Q12153 HRP1YOL123W 1605 nt6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.7 ms