Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA2P52292 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA2P52292 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms