Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CALRP27797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CALRP27797 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CALRP27797 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CALRP27797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALRP27797 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALRP27797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALRP27797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALRP27797 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALRP27797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALRP27797 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALRP27797 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALRP27797 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms