Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFITM1P13164 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFITM1P13164 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms