Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGAMP11215 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms