Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SMC4Q9NTJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMC4Q9NTJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMC4Q9NTJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms