Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BATF3Q9NR55 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms