Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCLK3Q9C098 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DCLK3Q9C098 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLK3Q9C098 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLK3Q9C098 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLK3Q9C098 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCLK3Q9C098 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms