Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITPNM3Q9BZ71 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PITPNM3Q9BZ71 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PITPNM3Q9BZ71 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms