Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms