Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GORASP1Q9BQQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GORASP1Q9BQQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms