Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PFDN5Q99471 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms