Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC45A3Q96JT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC45A3Q96JT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms