Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
APOBEC3HQ6NTF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOBEC3HQ6NTF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms