Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFTN1Q14699 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFTN1Q14699 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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