Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SNAPC2Q13487 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAPC2Q13487 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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