Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTF3Q12996 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTF3Q12996 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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