Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 BAG7YOR134W 1230 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 PEX27YOR193W 1131 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 ARR3YPR201W 1215 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 snR3snR3 194 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 MIF2YKL089W 1650 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YNL095CYNL095C 1929 nt5.01□□□□□ -1.61
HER1Q12276 DIN7YDR263C 1293 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 OKP1YGR179C 1221 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YKL169CYKL169C 384 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 PGA3YML125C 939 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YNL019CYNL019C 855 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YNL033WYNL033W 855 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 RPS19BYNL302C 435 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 GPM3YOL056W 912 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YPL014WYPL014W 1146 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 UBC4YBR082C 447 nt5□□□□□ -1.61
HER1Q12276 MLC1YGL106W 450 nt4.99□□□□□ -1.61
HER1Q12276 DCN1YLR128W 810 nt4.99□□□□□ -1.61
HER1Q12276 ERV41YML067C 1059 nt4.99□□□□□ -1.61
HER1Q12276 FUM1YPL262W 1467 nt4.99□□□□□ -1.61
HER1Q12276 GIP2YER054C 1647 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YOR1YGR281W 4434 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 RFT1YBL020W 1725 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YFL034WYFL034W 3222 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 MHF2YDL160C-A 243 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 SNM1YDR478W 597 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YIL086CYIL086C 309 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YLR402WYLR402W 192 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 IBA57YJR122W 1494 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 GSH2YOL049W 1476 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 IMA1YGR287C 1770 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 IXR1YKL032C 1794 nt4.98□□□□□ -1.61
HER1Q12276 SHE10YGL228W 1734 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 IFM1YOL023W 2031 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 TEA1YOR337W 2280 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 SEC9YGR009C 1956 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 GEP3YOR205C 1671 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 CNL1YDR357C 369 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YGL101WYGL101W 648 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 MRP13YGR084C 1020 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 HPM1YIL110W 1134 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 ERG3YLR056W 1098 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 YPL113CYPL113C 1191 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 SSO1YPL232W 873 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 TAZ1YPR140W 1146 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 UBA2YDR390C 1911 nt4.97□□□□□ -1.61
HER1Q12276 MKS1YNL076W 1755 nt4.96□□□□□ -1.61
HER1Q12276 KNH1YDL049C 807 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 DUO1YGL061C 744 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ADH4YGL256W 1149 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YGR283CYGR283C 1026 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 RSF1YMR030W 1131 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PIN2YOR104W 849 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PRM7YDL039C 2097 nt4.96□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PMT5YDL093W 2232 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 TRM8YDL201W 861 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 COX26YDR119W-A 201 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 TCA17YEL048C 459 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 RPL28YGL103W 450 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YOL107WYOL107W 1029 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YBR139WYBR139W 1527 nt4.95□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YHR177WYHR177W 1362 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ATH1YPR026W 3636 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 CAD1YDR423C 1230 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 AUA1YFL010W-A 285 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 SPO74YGL170C 1242 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YGR011WYGR011W 327 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 CAX4YGR036C 720 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YLF2YHL014C 1218 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YDC1YPL087W 954 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 ADE3YGR204W 2841 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 KAR1YNL188W 1302 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 HXT14YNL318C 1623 nt4.94□□□□□ -1.62
HER1Q12276 LUC7YDL087C 786 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 GCV1YDR019C 1203 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 SAY1YGR263C 1275 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YLR194CYLR194C 765 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 MTG1YMR097C 1104 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 HRT1YOL133W 366 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 DCP1YOL149W 696 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 IRC14YOR135C 342 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 GPI2YPL076W 843 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 UBA3YPR066W 900 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YCL041CYCL041C 495 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 PSE1YMR308C 3270 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 CAF4YKR036C 1932 nt4.93□□□□□ -1.62
HER1Q12276 MGR3YMR115W 1506 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 SOG2YOR353C 2376 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 GET3YDL100C 1065 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 RRP45YDR280W 918 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 SKI8YGL213C 1194 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.92□□□□□ -1.62
HER1Q12276 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.92□□□□□ -1.62
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