Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 GPN3YLR243W 819 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YBL029WYBL029W 1131 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPS28AYOR167C 204 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 CSH1YBR161W 1131 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 STB5YHR178W 2232 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 DUG1YFR044C 1446 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 HMLALPHA2YCL067C 633 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MATALPHA2YCR039C 633 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 NRG1YDR043C 696 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SNF11YDR073W 510 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YER186CYER186C 921 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SPO7YAL009W 780 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 CBF1YJR060W 1056 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPL10YLR075W 666 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YAR069CYAR069C 294 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MRPL4YLR439W 960 nt6.19□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 SUB1YMR039C 879 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MRPL16YBL038W 699 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SPO19YPL130W 672 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 ENV7YPL236C 1095 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MUD1YBR119W 897 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 KEL1YHR158C 3495 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 VPS5YOR069W 2028 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 VPS36YLR417W 1701 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 snR82snR82 268 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PDS1YDR113C 1122 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YGL132WYGL132W 336 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PRP38YGR075C 729 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 COS8YHL048W 1146 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 AIM18YHR198C 966 nt6.18□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 SDS3YIL084C 984 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 DJP1YIR004W 1299 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 AIM36YMR157C 768 nt6.18□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 GSP2YOR185C 663 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPB8YOR224C 441 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 EUG1YDR518W 1554 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 DFG5YMR238W 1377 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PKC1YBL105C 3456 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 CSC1YLR241W 2349 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 ATG7YHR171W 1893 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 TRP5YGL026C 2124 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 XBP1YIL101C 1944 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MRC1YCL061C 3291 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 EFT2YDR385W 2529 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 EFT1YOR133W 2529 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MSS2YDL107W 1056 nt6.17□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 RSR1YGR152C 819 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MOG1YJR074W 657 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YLL037WYLL037W 381 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YML119WYML119W 1074 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 NRK1YNL129W 723 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PGA2YNL149C 390 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 TEX1YNL253W 1269 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SUR1YPL057C 1149 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YNR066CYNR066C 1311 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 HSP78YDR258C 2436 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 EMW1YNL313C 2715 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YPK2YMR104C 2034 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YHL012WYHL012W 1482 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 IMA2YOL157C 1770 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 COX20YDR231C 618 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YDR282CYDR282C 1245 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 KEG1YFR042W 603 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPS2YGL123W 765 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 AIF1YNR074C 1137 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 CSI2YOL007C 1026 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RCL1YOL010W 1104 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YOR283WYOR283W 693 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 SPS4YOR313C 1017 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YCL041CYCL041C 495 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 FDC1YDR539W 1512 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 GIT1YCR098C 1557 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 PRI2YKL045W 1587 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPL7AYGL076C 735 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 UPF3YGR072W 1164 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 TAL1YLR354C 1008 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 NOP13YNL175C 1212 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YOR292CYOR292C 930 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 RPL7BYPL198W 735 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF3Q07807 MRPS5YBR251W 924 nt6.15□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF3Q07807 SUB2YDL084W 1341 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ADE12YNL220W 1302 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 AIM17YHL021C 1398 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 DIA3YDL024C 1407 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 AFG1YEL052W 1530 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 KTR7YIL085C 1554 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 RME1YGR044C 903 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 MED6YHR058C 888 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 COX2Q0250 756 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 PFS1YHR185C 714 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YJL068CYJL068C 900 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 YJU2YKL095W 837 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF3Q07807 ZRT2YLR130C 1269 nt6.14□□□□□ -1.43
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