Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.28e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.128e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 221.46■■□□□ 1.034e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 520.8■□□□□ 0.928e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 TRIM65-204ENST00000543309 865 ntTSL 219.51■□□□□ 0.714e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 518.64■□□□□ 0.578e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 518.64■□□□□ 0.578e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.58e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.278e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)9.46□□□□□ -0.898e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.81e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-202ENST00000336066 1843 ntTSL 1 (best)30.12■■■□□ 2.411e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.841e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-205ENST00000495692 967 ntTSL 324.93■■□□□ 1.581e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ZNF598-206ENST00000564824 2147 ntTSL 530.61■■■□□ 2.497e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.167e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 222.75■■□□□ 1.237e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.227e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 522.34■■□□□ 1.177e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.977e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.917e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.857e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 519.8■□□□□ 0.767e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.567e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.283e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.233e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ERRFI1-205ENST00000487559 787 ntTSL 228.98■■■□□ 2.233e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.523e-7■□□□□ 11.3
FKBP4Q02790 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 215.55■□□□□ 0.081e-10■□□□□ 11.2
FKBP4Q02790 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 314.85□□□□□ -0.031e-10■□□□□ 11.2
FKBP4Q02790 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 240.29■■■■■ 4.046e-8■□□□□ 11.2
FKBP4Q02790 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.691e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 334.49■■■■□ 3.114e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 34e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 330■■■□□ 2.394e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.344e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)28.15■■■□□ 2.14e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 527.83■■■□□ 2.054e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 427.83■■■□□ 2.054e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.954e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 327.22■■□□□ 1.954e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 327.05■■□□□ 1.924e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 526.16■■□□□ 1.784e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 324.59■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 224.59■■□□□ 1.534e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 324.19■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 AKT1-206ENST00000553797 783 ntTSL 324.15■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 224.07■■□□□ 1.444e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.44e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.334e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.024e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 420.88■□□□□ 0.934e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 520.44■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 TMEM37-203ENST00000417645 522 ntTSL 319.34■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.594e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.744e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.244e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 11.1
FKBP4Q02790 SMG1P3-201ENST00000435197 416 ntTSL 324.24■■□□□ 1.473e-6■□□□□ 11
FKBP4Q02790 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-9■□□□□ 10.9
FKBP4Q02790 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 10.9
FKBP4Q02790 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 314.05□□□□□ -0.163e-9■□□□□ 10.9
FKBP4Q02790 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)7.63□□□□□ -1.193e-9■□□□□ 10.9
FKBP4Q02790 MTA1-215ENST00000494981 509 ntTSL 318.96■□□□□ 0.634e-6■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.425e-6■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.44e-6■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 ZNF276-204ENST00000562530 1826 ntTSL 219.68■□□□□ 0.744e-6■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.889e-8■□□□□ 10.8
FKBP4Q02790 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 520.49■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 316.78■□□□□ 0.281e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.041e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.831e-8■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 FAM169A-205ENST00000513277 803 ntTSL 323.38■■□□□ 1.331e-7■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SH3BP2-216ENST00000510193 407 ntTSL 316.57■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.571e-7■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.71e-7■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 325.46■■□□□ 1.671e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.541e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.441e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 424.43■■□□□ 1.51e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 423.54■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 523.54■■□□□ 1.361e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 523.02■■□□□ 1.281e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 10.7
FKBP4Q02790 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 10.7
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 55.1 ms