RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.81■■■□□ 2.68
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.47■■■□□ 2.15
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCC9O60706 1549 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP2-216ENST00000510193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-216ENST00000510193 NACADO15069 1562 aa26.81■■□□□ 1.88
SH3BP2-216ENST00000510193 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-216ENST00000510193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BP2-216ENST00000510193 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-216ENST00000510193 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-216ENST00000510193 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-216ENST00000510193 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-216ENST00000510193 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-216ENST00000510193 SCRIBQ14160 1630 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-216ENST00000510193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-216ENST00000510193 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-216ENST00000510193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-216ENST00000510193 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-216ENST00000510193 SMARCA4P51532 1647 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-216ENST00000510193 NCAPD3P42695 1498 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-216ENST00000510193 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-216ENST00000510193 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-216ENST00000510193 SMARCA2P51531 1590 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-216ENST00000510193 HMGXB3Q12766 1538 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-216ENST00000510193 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-216ENST00000510193 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-216ENST00000510193 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-216ENST00000510193 NESP48681 1621 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-216ENST00000510193 ERCC6Q03468 1493 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP2-216ENST00000510193 WIZO95785 1651 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP2-216ENST00000510193 CUX2O14529 1486 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-216ENST00000510193 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-216ENST00000510193 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-216ENST00000510193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-216ENST00000510193 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-216ENST00000510193 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP2-216ENST00000510193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-216ENST00000510193 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-216ENST00000510193 CFTRP13569 1480 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-216ENST00000510193 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.79■■□□□ 1.4
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR62O43379 1518 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-216ENST00000510193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-216ENST00000510193 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-216ENST00000510193 PRDM2Q13029 1718 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-216ENST00000510193 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-216ENST00000510193 TOPBP1Q92547 1522 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-216ENST00000510193 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2-216ENST00000510193 IFT140Q96RY7 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCC8Q09428 1581 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2-216ENST00000510193 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SH3BP2-216ENST00000510193 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP2-216ENST00000510193 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP2-216ENST00000510193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-216ENST00000510193 CUX1P39880 1505 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-216ENST00000510193 OSCARQ8IYS5 282 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-216ENST00000510193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-216ENST00000510193 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-216ENST00000510193 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-216ENST00000510193 SOGA1O94964 1423 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-216ENST00000510193 CHD1O14646 1710 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR97A6NE52 1622 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-216ENST00000510193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 TRIM41Q8WV44 630 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ARHGEF11O15085 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 GRIN2BQ13224 1484 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 SYNJ1O43426 1573 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 PBRM1Q86U86 1689 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 TOP2BQ02880 1626 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 FBLN2P98095 1184 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 SYNJ2O15056 1496 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 ARAP1Q96P48 1450 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAMTS12P58397 1594 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-216ENST00000510193 GRIN2AQ12879 1464 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-216ENST00000510193 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-216ENST00000510193 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-216ENST00000510193 CEP170Q5SW79 1584 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-216ENST00000510193 NUP160Q12769 1436 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-216ENST00000510193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-216ENST00000510193 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-216ENST00000510193 SHROOM2Q13796 1616 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-216ENST00000510193 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.23■■□□□ 1.15
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF27Q86VH2 1401 aa22.21■■□□□ 1.15
SH3BP2-216ENST00000510193 IGF1RP08069 1367 aa22.2■■□□□ 1.14
SH3BP2-216ENST00000510193 CUL7Q14999 1698 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-216ENST00000510193 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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