Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH6P55285 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH6P55285 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH6P55285 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH6P55285 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH6P55285 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH6P55285 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH6P55285 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH6P55285 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH6P55285 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH6P55285 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH6P55285 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH6P55285 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH6P55285 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH6P55285 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH6P55285 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH6P55285 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH6P55285 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms