Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMS1P54277 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMS1P54277 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS1P54277 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS1P54277 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMS1P54277 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMS1P54277 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMS1P54277 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMS1P54277 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMS1P54277 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMS1P54277 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMS1P54277 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PMS1P54277 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS1P54277 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS1P54277 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS1P54277 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMS1P54277 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMS1P54277 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PMS1P54277 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS1P54277 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS1P54277 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS1P54277 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS1P54277 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PMS1P54277 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PMS1P54277 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms