Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.352e-12■■■■■ 36.7
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SUB1P53999 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-214ENST00000493324 3058 ntTSL 29.48□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-203ENST00000308710 2086 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-201ENST00000280699 1897 ntTSL 55.11□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-210ENST00000467224 722 ntTSL 34.82□□□□□ -1.642e-7■■■■■ 36.6
SUB1P53999 NGLY1-215ENST00000496726 3196 ntTSL 24.32□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 36.6
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SUB1P53999 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 54.23□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 36.6
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SUB1P53999 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.741e-14■■■■■ 36.6
SUB1P53999 PDHX-202ENST00000430469 952 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.991e-14■■■■■ 36.6
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SUB1P53999 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 36.5
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SUB1P53999 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.454e-8■■■■■ 36.5
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SUB1P53999 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 36.4
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SUB1P53999 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 36.4
SUB1P53999 TARS-209ENST00000507716 2475 ntTSL 26.42□□□□□ -1.383e-11■■■■■ 36.4
SUB1P53999 TARS-205ENST00000503422 760 ntTSL 22.1□□□□□ -2.073e-11■■■■■ 36.4
SUB1P53999 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 36.3
SUB1P53999 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 36.3
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SUB1P53999 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.856e-10■■■■■ 36.1
SUB1P53999 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.56□□□□□ -1.26e-10■■■■■ 36.1
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SUB1P53999 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 SUMO3-206ENST00000479153 1736 ntTSL 210.19□□□□□ -0.789e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 NNT-203ENST00000503059 634 ntTSL 33.21□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 36
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SUB1P53999 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 PHKB-210ENST00000566319 3080 ntTSL 25.77□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 PHKB-204ENST00000564711 697 ntTSL 55.72□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 36
SUB1P53999 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 35.9
SUB1P53999 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 35.9
SUB1P53999 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-13■■■■■ 35.9
SUB1P53999 POLR3K-202ENST00000481810 907 ntTSL 210.25□□□□□ -0.774e-13■■■■■ 35.9
SUB1P53999 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 35.8
SUB1P53999 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 35.8
SUB1P53999 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-21■■■■■ 35.8
SUB1P53999 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 312.06□□□□□ -0.483e-21■■■■■ 35.8
SUB1P53999 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 56.63□□□□□ -1.353e-21■■■■■ 35.8
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