Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCLCP48506 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCLCP48506 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCLCP48506 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCLCP48506 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCLCP48506 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCLCP48506 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCLCP48506 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCLCP48506 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCLCP48506 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCLCP48506 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCLCP48506 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCLCP48506 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCLCP48506 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCLCP48506 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms