Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CASP2P42575 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP2P42575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP2P42575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP2P42575 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP2P42575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms