Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	VID22	YLR373C	2706 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	BNA6	YFR047C	888 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	PCT1	YGR202C	1275 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YAR023C	YAR023C	540 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	NMD4	YLR363C	657 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YPR109W	YPR109W	885 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	DPH6	YLR143W	2058 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	TFC7	YOR110W	1308 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	SSB2	YNL209W	1842 nt		4.67	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	CEG1	YGL130W	1380 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	TDA7	YNL176C	1911 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	MKS1	YNL076W	1755 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	VAN1	YML115C	1608 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	ENT5	YDR153C	1236 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	HAL1	YPR005C	885 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	YMR196W	YMR196W	3267 nt		4.66	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	TAF5	YBR198C	2397 nt		4.65	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	RCK2	YLR248W	1833 nt		4.65	□□□□□ -1.66
ATG12	P38316	DCD1	YHR144C	939 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YKL107W	YKL107W	930 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	TUB3	YML124C	1338 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PTR2	YKR093W	1806 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	CLA4	YNL298W	2529 nt		4.65	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	EXO1	YOR033C	2109 nt		4.64	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PRP31	YGR091W	1485 nt		4.64	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	CPR4	YCR069W	957 nt		4.64	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PEX7	YDR142C	1128 nt		4.64	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RRN9	YMR270C	1098 nt		4.64	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YGR066C	YGR066C	879 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	COG5	YNL051W	1212 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PCL1	YNL289W	840 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	CLF1	YLR117C	2064 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.63	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	ALG6	YOR002W	1635 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	SAP4	YGL229C	2457 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PDE1	YGL248W	1110 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	ICY2	YPL250C	411 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YPL278C	YPL278C	303 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	snR32	snR32	188 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	DIT2	YDR402C	1470 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RAD28	YDR030C	1521 nt		4.62	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RXT3	YDL076C	885 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	SPC34	YKR037C	888 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YNG1	YOR064C	660 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RRB1	YMR131C	1536 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	AKL1	YBR059C	3327 nt		4.61	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RHO3	YIL118W	696 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	KRE9	YJL174W	831 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YAR061W	YAR061W	204 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	YNL181W	YNL181W	1224 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.6	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	CDC10	YCR002C	969 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	URA3	YEL021W	804 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	RFC2	YJR068W	1062 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	WTM1	YOR230W	1314 nt		4.59	□□□□□ -1.67
ATG12	P38316	ATG1	YGL180W	2694 nt		4.59	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	ENV9	YOR246C	993 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YHR182W	YHR182W	2358 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.58	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	FRT2	YAL028W	1587 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	ZPR1	YGR211W	1461 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YNL095C	YNL095C	1929 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	HNT2	YDR305C	654 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YHR095W	YHR095W	495 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YNL228W	YNL228W	777 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	NRM1	YNR009W	750 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	PRT1	YOR361C	2292 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	FOX2	YKR009C	2703 nt		4.57	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68
ATG12	P38316	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.56	□□□□□ -1.68

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