Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSFA2P28290 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSFA2P28290 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSFA2P28290 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 599 ms