Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB4P28070 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB4P28070 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms