Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L8P0C7I0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L8P0C7I0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L8P0C7I0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms