Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4BP1O75113 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4BP1O75113 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms