Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACD1B0YJ81 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACD1B0YJ81 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HACD1B0YJ81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms