Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIAS3Q9Y6X2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIAS3Q9Y6X2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms