Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB6Q9Y5E3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB6Q9Y5E3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB6Q9Y5E3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms