Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NOP58Q9Y2X3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NOP58Q9Y2X3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NOP58Q9Y2X3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms