Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms