Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPUSD1Q9UJJ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms