Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD1Q9UHL9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms