Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BSDC1Q9NW68 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BSDC1Q9NW68 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms