Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PREBQ9HCU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PREBQ9HCU5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms