Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USB1Q9BQ65 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USB1Q9BQ65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms