Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA3Q99618 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA3Q99618 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms