Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PRRC1Q96M27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PRRC1Q96M27 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms