Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS4Q8WXH5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS4Q8WXH5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOCS4Q8WXH5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms