Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3Q8WWT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms