Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BHLHE23Q8NDY6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE23Q8NDY6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE23Q8NDY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms