Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPARGC1BQ86YN6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PPARGC1BQ86YN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PPARGC1BQ86YN6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPARGC1BQ86YN6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms